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3672个物种中，包括陆生维管植物1742种，陆生脊椎动物410种，陆生昆虫699种，水生生物712种，大型线种，并呈现诸多特征。其中，多个昆虫种类发现打破历史纪录，南京在全国新记录昆虫3种（高丽嗡蜣螂、达氏嗡蜣螂和臭蜉金龟），江苏新记录昆虫3种（假巨歧长角石蛾、蕈步甲和方胸青步甲）。越来越多珍稀野生动植物在南京扎根，特别是玄武湖明城墙基部发现了一株迄今为止世界城市环境中天然更新的最大水杉小树及最大种群，紫金山南麓落叶阔叶林下新发现迄今为止我国城市森林中已知天然更新的最大南方红豆杉种群。野生动物数量持续增多，全市共记录鸟类20目66科188属334种，比2016年历史记录多了46种。长江南京段是目前整个长江干流江豚分布密度最高的江段之一。南京长江江豚省级自然保护区内稳定栖居的长江江豚数量约62头，占干流长江江豚总数量的10.4%。调查结果较2017年科考数据相比，增长24%，年均增长率4.4%。
